《半獸人的煩惱》故事背景是在一個架空的人類社會，在這裡有翼人、龍人、長耳人、角人、牧神人、人魚、人馬…… 等不同種族，這是一個什麼樣的人都有，唯獨沒有我們所熟知的「人類」的世界。君原姬乃是個住在彼方市裡的人馬高中女生，她和好朋友希、羌子，還有許多同學們，一起度過普通的高中生活。女生之間的悄悄話、話劇表演、戀愛話題、對未來的憧憬…… 作品描述在這樣一個奇妙世界裡的學園生活。